Vi underlægger vores områder den strammeste beskyttelse muligt for private aktører. Vi har ligeledes et mål om, på sigt, at få vores reservater inkluderet i SNAP (Sistema Nacional de Áreas Protegidas del Ecuador). Såfremt de bliver inkluderet i SNAP, er områderne ikke bare beskyttet af private aktører, men også af staten selv. 

Man kan opsummere den beskyttelse vi laver således: Man må intet der skader naturen i et JungleFonden-reservat. Alle vores metoder er ikke-invasive. Det vil sige, at de forstyrrer naturen minimalt. De ikke-invasive metoder er fx vores vildtkameraer, der sidder skjult langs en sti, eller vores mikrofoner, der er skjult i træer. Vores rangers patruljerer nogle stier, der ikke er meget større end dem, en bjergtapir kan lave, og såfremt I selv vil ud og se den skov, I kan være med til at beskytte, vil det også være disse uanselige, men let fremkommelige, veje ind i skoven, I vil bruge.

I JungleFondens vedtægter har vi indskrevet, at hvis JungleFonden af den ene eller anden årsag ophører med at eksistere, overgår alle områder i fondens besiddelse til Jocotoco. Den beskyttelse de laver, er lige så kompromisløs som vores.